Pracoviště je akreditovaným školicím pracovištěm II. typu pro lékaře připravující se ke specializované způsobilosti v oboru „Alergologie a klinická imunologie“.

Zaměstnanci ÚKIA přednáší i v rámci postgraduální výuky. Pracovníci působí jako školitelé či školitelé specialisté v doktorských studijních programech např. oborové rady Imunologie a Fyziologie a patofyziologie člověka v rámci postgraduálního vzdělávání v biomedicíně.

Zaměstnanci ÚKIA rovněž přednáší v rámci specializační přípravy nelékařských pracovníků ve zdravotnictví a podílí se na výuce Univerzity třetího věku.

V roce 1991 si mohutný rozvoj imunologie a její velký klinický význam vynutily konstituování imunologie jako samostatného oboru na 1. lékařské fakultě. Výuka imunologie byla zpočátku zajišťována Ústavem pro lékařskou mikrobiologii a imunologii. V roce 1994 vznikl spojením Laboratoře pro speciální lékařskou mikrobiologii a imunologii vedené prof. Milanem Márou a Oddělení klinické imunologie Všeobecné fakultní nemocnice vedené prof. Terezií Fučíkovou Ústav klinické imunologie a prof. Fučíková se stala jeho přednostkou. V roce 2001 došlo z organizačních důvodů znovu ke spojení mikrobiologie a imunologie v Ústav imunologie a mikrobiologie (vedený postupně prof. Ivanem Šterzlem a prof. Libuší Kolářovou), který existoval do konce roku 2024 a na začátku roku 2025 se transformoval opět do dvou samostatných ústavů: Ústav lékařské mikrobiologie a Ústav klinické imunologie a alergologie. Prvním přednostou Ústavu klinické imunologie a alergologie se stal prof. RNDr. Jiří Hrdý, PhD.

Ambulance Oddělení klinické imunologie a alergologie zajišťují komplexní alergologickou a imunologickou péči na úrovni specializovaných ambulancí fakultní nemocnice (prevence, diagnostika, dispenzarizace, terapie) včetně konziliárních služeb. Pracoviště se podílí i na postgraduální výuce klinické imunologie a alergologie.